中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所
成立于1959年，在2001-2003年經(jīng)由原中國(guó)科學(xué)院遺傳研究所、發(fā)育生物學(xué)研究所及石家莊農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化研究所整合而組成現(xiàn)在的研究所。
中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所
始建于1956年，是專業(yè)從事病毒學(xué)研究的綜合性研究機(jī)構(gòu)。
中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所
成立于1959年4月，其前身為昆蟲研究所紫膠站。1963年曾改名為中國(guó)科學(xué)院西南動(dòng)物研究所。
中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研究所
成立于1962年，是以從事青藏高原生物科學(xué)研究(包括基礎(chǔ)理論、應(yīng)用基礎(chǔ)和應(yīng)用開發(fā)研究)為主的公益性綜合研究所，其前身是中國(guó)科學(xué)院青海分院生物研究所。
中國(guó)科學(xué)院遙感應(yīng)用研究所
1979年成立，作為我國(guó)遙感科學(xué)與綜合應(yīng)用技術(shù)國(guó)家級(jí)、開放型研究機(jī)構(gòu)。
中國(guó)科學(xué)院大氣物理研究所
大氣所的前身是1928年成立的中央研究院氣象研究所，竺可楨、趙九章、顧震潮、葉篤正、陶詩言、曾慶存、洪鐘祥、王明星等著名學(xué)者曾先后擔(dān)任所長(zhǎng)。
中國(guó)科學(xué)院南京地質(zhì)古生物研究所
成立于1951年5月7日，其前身為中央研究院地質(zhì)研究所及前中央地質(zhì)調(diào)查所等機(jī)構(gòu)的古生物室（組）。
中國(guó)科學(xué)院南京土壤研究所
成立于1953年，其前身為1930年創(chuàng)立的中央地質(zhì)調(diào)查所土壤研究室。以土壤學(xué)基礎(chǔ)和應(yīng)用基礎(chǔ)研究為主的社會(huì)公益性研究所。
中國(guó)科學(xué)院測(cè)量與地球物理研究所
成立于1957年，是中國(guó)在大地測(cè)量領(lǐng)域最早的研究機(jī)構(gòu)，也是中國(guó)科學(xué)院唯一從事大地測(cè)量學(xué)研究的研究所，1970年歸屬國(guó)家地震局，1978年在鄧小平同志的關(guān)懷下，由中國(guó)科學(xué)院恢復(fù)重建。
中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所
成立于1959年1月，是我國(guó)規(guī)模最大的綜合性海洋研究機(jī)構(gòu)之一，為中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程序列單位。從事海洋地質(zhì)、地球物理、水文、氣象等研究。
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